随着大数据、人工智能、云计算等新一代技术的勃兴，算法逐步成为电商平台知识产权侵权治理的新型手段，且主要呈现为算法检测机制和算法通知机制，二者基于同一技术原理，属“同一事物的两个面”。算法技术的异化和滥用都有可能导致电商平台知识产权算法治理的伦理风险，从算法技术本体来说，建立模型、数据输入以及输出结果三个阶段皆存在一定隐患；从算法应用主体来说，成本考量、侵权责任规避以及利益诱导都会成为主体滥用算法的因素。社会主义核心价值观融入电商平台知识产权算法治理是坚持依法治国和以德治国相结合的必然要求，也是实现中国式法治现代化的应有举措。以技术伦理学“内在主义研究进路+外在主义研究进路”为逻辑思路，社会主义核心价值观与电商平台知识产权算法治理的结合，可被提炼为电商平台知识产权算法治理整体的宏观切入点，以及算法“科技向善”、禁止知识产权滥用、电商平台自治权三个微观切入点，同时对应法治、文明与公正、诚信、自由及民主价值观。遵循“技术本身-技术应用”理念，进一步针对算法程序设计的三个阶段，建议将其纳入公共利益考量、建立信息共享机制、设立算法“反通知”程序，同时在算法运用限度上，目前应坚持算法过滤的非义务属性和完善恶意通知的治理措施。