随着“以票控税”向“以数治税”转型的时代来临，电子发票是财税数字化转型的关键内容，在税收征管中发挥着关键作用。但是，我国电子发票的配套制度不够完善，缺少涉税数据保护的具体规则。从概念界定、权力结构和责任与归责机制看，数据保护的一般性规则在电子发票涉税数据保护中具有局限性。电子发票的参与主体多样，适用环节逐步扩大。因此，在涉税数据传输过程中，应当平衡公共价值与私法权益保护，注重个人信息与商业秘密的保护。根据域外经验，在发展诸如区块链、云服务、智能合约等技术的同时，应当遵循技术中立原则：如欧盟在电子发票涉税数据保护中，遵循目的限制原则、比例原则和数据最小化原则；《瑞士增值税法》也规定了涉税数据保护规则。建议将涉税数据保护纳入立法考量，通过制定《中华人民共和国增值税法》及其实施条例和修订《中华人民共和国发票管理办法》及《中华人民共和国网络发票管理办法》来保障涉税数据安全。