1株牛阿卡斑病毒全基因组的测定分析及荧光定量PCR检测方法的建立

尚佳富, 胡乐, 李明科, 吴钰键, 倪兴维, 杨晓伟, 刘霞, 张立武, 徐婷婷, 赵光伟

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中国兽医学报 ›› 2024, Vol. 44 ›› Issue (09) : 1872-1881. DOI: 10.16303/j.cnki.1005-4545.2024.09.05

1株牛阿卡斑病毒全基因组的测定分析及荧光定量PCR检测方法的建立

  • 尚佳富, 胡乐, 李明科, 吴钰键, 倪兴维, 杨晓伟, 刘霞, 张立武, 徐婷婷, 赵光伟
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摘要

为了解贵州省阿卡斑病(Akabane disease, AKAD)流行情况及毒株的分子特征,本试验对一牛源AKAD阳性病料进行阿卡斑病毒(Akabane virus, AKAV)的全基因组测序,构建系统进化树,探究该毒株基因型和遗传变异情况,根据该毒株保守S序列建立其荧光定量PCR检测方法,并对该省4个规模化肉牛养殖场进行AKAV感染情况的调查。结果显示,该毒株S、M和L片段与中国天津株(TJ2016/China/2016)和澳大利亚株(JaLAB39/Australia/1959)高度同源,且均处于同一进化分支,为基因Ⅱ型;对所建立荧光定量PCR方法的灵敏性、特异性和重复性进行评估,显示其最低检出下限为2.5×10~1 copies/μL,对牛蓝舌病病毒(bovine bluetongue virus, BLUV)、多杀性巴氏杆菌(Pasteurella multocida,PM)、牛传染性鼻气管炎病毒(bovine infectious rhinotracheitis virus, IBRV)和牛支原体(bovine Mycoplasma bovis)均未出现扩增,重复性试验的批间和批内变异系数均低于2.26%,说明所建方法灵敏性高、特异性好,具有良好的重复性和稳定性;利用该方法对贵州黔西市和黄平县4个规模化肉牛养殖场共298份血清样本进行检测,共发现25份阳性样本,阳性率8.39%。本试验结果为深入了解AKAV在贵州省的分子流行情况提供了数据参考,对AKAD的综合防控奠定了基础。

关键词

阿卡斑病毒 / 全基因组 / 荧光定量PCR / / 贵州省

中图分类号

S852.65

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尚佳富, 胡乐, 李明科, 吴钰键, 倪兴维, 杨晓伟, 刘霞, 张立武, 徐婷婷, 赵光伟. 1株牛阿卡斑病毒全基因组的测定分析及荧光定量PCR检测方法的建立. 中国兽医学报. 2024, 44(09): 1872-1881 https://doi.org/10.16303/j.cnki.1005-4545.2024.09.05

基金

贵州省科技基金资助项目(黔科合支撑[2023]一般022)

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