H10亚型禽流感病毒TaqMan探针实时荧光定量PCR检测方法的建立

张雅馨, 毛秋艳, 刘朔, 周婉婷, 周淑宁, 彭程, 李金平, 刘华雷, 蒋文明, 格日勒图

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中国兽医学报 ›› 2024, Vol. 44 ›› Issue (05) : 893-899. DOI: 10.16303/j.cnki.1005-4545.2024.05.03

H10亚型禽流感病毒TaqMan探针实时荧光定量PCR检测方法的建立

  • 张雅馨, 毛秋艳, 刘朔, 周婉婷, 周淑宁, 彭程, 李金平, 刘华雷, 蒋文明, 格日勒图
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摘要

从NCBI和GISAID数据库中下载H10亚型禽流感病毒的HA基因序列信息,与本实验室保存毒株的序列进行比对、分析、筛选,选择其共同保守区域设计荧光引物和探针,优化反应体系和条件,并验证该方法的特异性、敏感性和重复性。结果显示,该方法具有高度特异性,与其他几种禽源性病毒均无交叉反应;敏感性可达到1.7×10~2拷贝/μL,比普通RT-PCR敏感10倍;批内和批间重复的变异系数(C_v)均小于1.4%,稳定性较好;分别使用鸡胚接种病毒分离法、本研究建立的TaqMan探针实时荧光定量PCR和普通RT-PCR检测鸡感染试验的拭子和组织样品,结果显示病毒分离法与本研究建立的实时荧光定量PCR方法的总符合率为94.44%,而与普通RT-PCR方法的总符合率为90.74%,实时荧光定量PCR的阳性检出率比RT-PCR更高。结果表明,建立的TaqMan探针实时荧光定量PCR检测方法具有较好的特异性、敏感性和稳定性,有助于H10亚型禽流感病毒的临床检测和监测,对其防控具有一定意义。

关键词

H10亚型禽流感病毒 / TaqMan探针 / 实时荧光定量PCR / HA基因

中图分类号

S855.3

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张雅馨, 毛秋艳, 刘朔, 周婉婷, 周淑宁, 彭程, 李金平, 刘华雷, 蒋文明, 格日勒图. H10亚型禽流感病毒TaqMan探针实时荧光定量PCR检测方法的建立. 中国兽医学报. 2024, 44(05): 893-899 https://doi.org/10.16303/j.cnki.1005-4545.2024.05.03

基金

山东省重点研发计划资助项目(2022CXGC010606)

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