乙型流感病毒TaqMan荧光定量PCR分型检测方法的建立及初步应用

赵文欣, 朱翔宇, 肖妍, 韩继成, 哈卓, 张赫, 谢宇飚, 鲁会军, 金宁一

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中国兽医学报 ›› 2024, Vol. 44 ›› Issue (04) : 685-691. DOI: 10.16303/j.cnki.1005-4545.2024.04.06

乙型流感病毒TaqMan荧光定量PCR分型检测方法的建立及初步应用

  • 赵文欣, 朱翔宇, 肖妍, 韩继成, 哈卓, 张赫, 谢宇飚, 鲁会军, 金宁一
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摘要

通过比对GISAID登录的乙型流感病毒Victoria谱系、Yamagata谱系HA基因序列,选择保守区域设计并合成1对引物及2条荧光探针,以实验室保存的乙型流感毒株RNA为模板分别扩增Victoria谱系和Yamagata谱系HA基因片段,构建重组质粒标准品pUC57-Vic和pUC57-Yama,经PCR及测序鉴定正确后作为质粒标准品,初步建立乙型流感病毒的TaqMan荧光定量PCR(real-time quantitative reverse transcription PCR,qRT-PCR)分型检测方法。结果显示,该方法可以特异的鉴别检测乙型流感Victoria谱系、Yamagata谱系病毒RNA,对甲型流感病毒、EB病毒、腺病毒等RNA/DNA的检测结果均为阴性;对重组质粒标准品的检测限分别为333、2 940拷贝/μL;批内与批间的重复性试验的变异系数均小于2%,表明所建立的检测方法特异性良好、灵敏度较高、重复性好;利用该方法与常规反转录PCR(RT-PCR)方法对10份流感样病例咽拭子进行检测,检测结果一致(3/10)。结果表明,本试验建立的乙型流感病毒TaqMan荧光定量PCR分型检测方法能够检测乙型流感病毒,为乙型流感病毒Victoria谱系及Yamagata谱系的鉴别提供更加快速准确的定量检测手段。

关键词

乙型流感病毒 / TaqMan荧光定量PCR / 血凝素

中图分类号

S852.65

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赵文欣, 朱翔宇, 肖妍, 韩继成, 哈卓, 张赫, 谢宇飚, 鲁会军, 金宁一. 乙型流感病毒TaqMan荧光定量PCR分型检测方法的建立及初步应用. 中国兽医学报. 2024, 44(04): 685-691 https://doi.org/10.16303/j.cnki.1005-4545.2024.04.06

基金

国家重点研发计划资助项目(2021YFC2302503)

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