猪流感病毒TaqMan荧光定量RT-PCR检测方法的建立

黄书, 梁海英, 曾智勇, 汤德元, 王彬, 叶泥, 边孟婷, 柳佳佳, 潘向英, 田红利

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中国兽医学报 ›› 2024, Vol. 44 ›› Issue (04) : 651-656. DOI: 10.16303/j.cnki.1005-4545.2024.04.01

猪流感病毒TaqMan荧光定量RT-PCR检测方法的建立

  • 黄书, 梁海英, 曾智勇, 汤德元, 王彬, 叶泥, 边孟婷, 柳佳佳, 潘向英, 田红利
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摘要

参照GenBank登录的猪流感病毒(swine influenza virus, SIV)基质蛋白(matrix protein, M)基因保守序列设计1对特异性引物和1个TaqMan探针,构建重组质粒作为绝对定量模板,通过优化反应体系及条件建立了检测SIV的荧光定量RT-PCR方法,测试了该方法的特异性、灵敏度及重复性。结果显示,建立的方法与猪瘟病毒、猪蓝耳病毒、猪流行性腹泻病毒、猪传染性胃肠炎病毒、猪圆环病毒2型、猪伪狂犬病病毒、猪细小病毒和猪乙型脑炎病毒等不存在交叉反应,特异性强;最低检测限度为1.0拷贝/μL,比普通RT-PCR方法灵敏10倍;组内和组间重复性试验的变异系数分别在2.2%和1.9%以下,重复性较好;应用该方法对220份临床疑似猪流感样品进行检测,荧光定量RT-PCR方法和普通RT-PCR检测率分别为2.7%和1.8%,阳性符合率为100%。结果表明,建立的TaqMan荧光定量RT-PCR方法特异性强、灵敏度高、重复性好,可快速检测样品中的各种SIV,从而更好地诊断和监测猪流感。

关键词

猪流感病毒 / TaqMan探针 / 荧光定量RT-PCR方法

中图分类号

S852.651

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黄书, 梁海英, 曾智勇, 汤德元, 王彬, 叶泥, 边孟婷, 柳佳佳, 潘向英, 田红利. 猪流感病毒TaqMan荧光定量RT-PCR检测方法的建立. 中国兽医学报. 2024, 44(04): 651-656 https://doi.org/10.16303/j.cnki.1005-4545.2024.04.01

基金

贵州省科技支撑计划资助项目(黔科合支撑[2021]一般162项目)

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