金属离子对二甲亚砜依赖的RNA切割型脱氧核酶催化活性的影响

崔力, 李素慧, 郑星, 常天俊, 邴涛

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高等学校化学学报 ›› 2024, Vol. 45 ›› Issue (04) : 128-135.

金属离子对二甲亚砜依赖的RNA切割型脱氧核酶催化活性的影响

  • 崔力, 李素慧, 郑星, 常天俊, 邴涛
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摘要

在高浓度有机溶剂中工作的RNA切割型脱氧核酶(RNA-cleaving DNAzyme,RCD)及其构筑的分子器件不仅拓展了DNA作为酶的能力,还可将功能核酸推进新的应用领域.本文研究了一个需要二甲亚砜才能工作的RCD(命名为E3)对金属离子的需求,发现二价金属离子对其催化活性至关重要,活性顺序为Zn~(2+),Mg~(2+)>Fe~(2+)>Pb~(2+)>Mn~(2+)>Co~(2+).以Mg~(2+)或Zn~(2+)为辅因子,表征了E3的速率-pH值关系及其与二者的结合比例.E3的催化速率-pH曲线在Mg~(2+)存在下为“钟形”,高速率的pH值范围为7.0~9.0;Zn~(2+)存在下为“尖峰”,速率最高时pH=7.0;E3与Mg~(2+)和Zn~(2+)的数量结合比例均为1∶1.另外,E3以Fe~(2+)为辅因子时易失活,Fe~(2+)被氧化成Fe~(3+)是失活的关键,加入还原剂可使其复活.进一步研究发现,Cu~(2+),Fe~(3+)和Ni~(2+)等金属离子可抑制Mg~(2+)或Zn~(2+)的作用,使E3的催化活性急剧降低.本文研究结果为理解E3的性质及催化机制提供了有用信息.

关键词

RNA切割型脱氧核酶 / 功能核酸 / 有机溶剂 / 金属离子

中图分类号

TQ426.97 / Q55

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崔力, 李素慧, 郑星, 常天俊, 邴涛. 金属离子对二甲亚砜依赖的RNA切割型脱氧核酶催化活性的影响. 高等学校化学学报. 2024, 45(04): 128-135

基金

国家自然科学基金(批准号:U1704241,22274139); 浙江省自然科学基金(批准号:YXD24B0401); 浙江省“尖兵”“领雁”研发攻关计划(批准号:2023SDYXS0002); 国家卫生健康委科学研究基金-浙江省卫生健康重大科技计划(批准号:WKJ-ZJ-2424); 浙江省核酸适体与临床诊治重点实验室开放基金项目(批准号:2022ASC001)资助

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