医学免疫学与微生物学是联系基础医学和临床医学的重要课程，依照新医科教育背景下课程“两性一度”建设标准，推进实验课程的建设和改革是影响医学生培养质量的重要环节。在传统教学方式下，学生常面临知识脱节、挑战度不足、思维和能力欠缺等问题，导致理论联系实际及处理复杂问题的能力较差，教学效果不尽如人意。通过采取一系列创新举措，包括革新教学理念、整合教学内容、改革教学方法、完善教学资源及设定新的教学评价体系，成功构建了医学免疫学与微生物学整合实验教学体系，并在中医学专业教学中进行了实践。该教学体系以解决临床及科研问题为切入点，以基本知识和技术为支撑，引导学生自主设计实验、完成任务、讨论分析，并将项目成果化。改革有效解决了教学中的痛点问题，高质量实现了既定教学目标，显著提升了教学效果，受到学生一致好评。