目的 通过基因组生物信息学分析探讨阿尔茨海默病（Alzheimer's disease,AD）神经系统相关共病（癫痫、睡眠剥夺、抑郁症）异病同证生物学基础。方法 下载GSE63060、GSE63061、GSE140829、GSE143272、GSE98565和GSE98793数据集作为研究对象，运用韦恩工具筛选各疾病组与正常对照组之间的差异基因，运用Cytoscape软件拓扑分析筛选核心基因，运用Omic Share平台对核心基因进行基因本体论（gene ontology,GO）/京都基因和基因组百科全书（Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）富集分析。结果 共筛选出33个核心基因，GO富集分析显示核心基因在生物过程主要富集于细胞进程、代谢进程、生物调控、生物进程调控、刺激反应、信号传递、发育进程、多细胞生物进程、免疫系统进程、多生物进程、生殖进程、病毒进程，在细胞成分主要富集于细胞解剖实体、含蛋白复合物，在分子功能主要富集于结合途径、结构分子途径、催化活性、翻译调节活性、转录调节活性、ATP依赖性活性、分子功能调节因子、分子适配器活性、分子载体活性、分子换能器活性；KEGG富集分析显示核心基因主要富集于核糖体、高级糖基化终末产物-受体信号通路、辅助性T细胞17(T helper cell 17,Th17)细胞分化、介导细胞与细胞之间信号通路、缺氧诱导因子信号通路、程序性死亡配体1表达以及程序性死亡受体1检查点信号通路。结论 运用基因组生物信息学分析探讨AD神经系统相关共病核心基因以及信号通路，能够在一定程度上揭示AD神经系统相关共病“异病同证”作用机制，对于阐述中医现代化研究以及个体化诊疗科学内涵具有重要意义。