生防假单胞菌FD6中小RNA cspA功能的初步研究

肖垚, 孙林夕, 李子寒, 高子影, 胡婕妤, 朱宇昕, 张清霞

扬州大学学报(农业与生命科学版) ›› 2024, Vol. 45 ›› Issue (06) : 120-128. DOI: 10.16872/j.cnki.1671-4652.2024.06.015

生防假单胞菌FD6中小RNA cspA功能的初步研究

  • 肖垚, 孙林夕, 李子寒, 高子影, 胡婕妤, 朱宇昕, 张清霞
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摘要

生防假单胞菌FD6抑菌谱广,可产生多种次生代谢产物。细菌小RNA参与调节细胞的不同生理过程,为探究生防假单胞菌FD6中小RNA cspA对生防相关性状表达的影响,从菌株FD6基因组中挖掘出3个同源小RNA cspA1、cspA2、cspA3,对其进行生物信息学分析,并采用过量表达和插入突变的方法鉴定其生物学功能。结果表明:cspA1、cspA2、cspA3的RNA序列长度分别为356、416、397 bp,均具有启动子和Rho-independent终止子。cspA1、cspA2、cspA3核苷酸相似性达66.35%,其基因与猪链球菌基因组中的cspA相似性达59%。cspA2、cspA3过表达可降低胞外蛋白酶的产生;cspA1、cspA2、cspA3过表达显著降低FD6的游动能力;cspA1、cspA2过表达及cspA3突变可降低嗜铁素的分泌;cspA2过表达促进FD6生物膜的形成,而cspA1、cspA2突变则导致其生物膜形成能力降低。综上,cspA1、cspA2、cspA3基因可能参与调控不同生防表型,今后需进一步解析其生物学功能及调控机制。

关键词

生防假单胞菌 / FD6 / 小RNA cspA / 生防相关表型

中图分类号

S476

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肖垚, 孙林夕, 李子寒, 高子影, 胡婕妤, 朱宇昕, 张清霞. 生防假单胞菌FD6中小RNA cspA功能的初步研究. 扬州大学学报(农业与生命科学版). 2024, 45(06): 120-128 https://doi.org/10.16872/j.cnki.1671-4652.2024.06.015

基金

国家自然科学基金资助项目(32472628、32072471); 江苏省高等学校大学生创新创业训练计划项目(202311117021Z)

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