甜瓜锚定蛋白ANK家族基因生物信息学鉴定分析

doi:10.13568/j.cnki.651094.651316.2024.02.20.0001

新疆大学学报（自然科学版中英文） ›› 2025, Vol. 42 ›› Issue (01) : 55-65. DOI: 10.13568/j.cnki.651094.651316.2024.02.20.0001

张蓉蓉, 范满良, 卢思敏, 彭凯, 慧杰杰, 宁雪飞

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摘要

ANK(Ankyrin)锚定蛋白家族编码ANK结构域，植物中ANK家族基因参与调控植物对生物与非生物胁迫的响应．基于甜瓜全基因组及转录组测序数据，对甜瓜中ANK家族基因进行鉴定，分析其空间表达模式及胁迫响应表达模式．共鉴定出78个ANK基因，分为11个亚族；系统进化树分析将甜瓜ANK成员分为7大亚簇，种内8对ANK基因存在共线性关系，5个ANK基因与拟南芥、水稻、黄瓜存在种间共线性关系．CmANK家族基因在不同组织差异表达，不同胁迫下表达亦有所不同．CmANK30在非生物和生物胁迫下均呈现明显的上调表达，表明该基因积极参与逆境胁迫响应调控．

关键词

甜瓜 / ANK / 家族基因 / 生物信息学 / 表达分析

中图分类号

S652

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张蓉蓉, 范满良, 卢思敏, 彭凯, 慧杰杰, 宁雪飞. 甜瓜锚定蛋白ANK家族基因生物信息学鉴定分析. 新疆大学学报（自然科学版中英文）. 2025, 42(01): 55-65 https://doi.org/10.13568/j.cnki.651094.651316.2024.02.20.0001

基金

国家自然科学基金“甜瓜霜霉病抗性基因定位克隆及功能分析”（32060688）; 新疆维吾尔自治区天池博士项目“甜瓜抗霜霉病基因DM-QTL4精细定位”（2020660020）

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2025-06-30

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