基于网络邻近度的活性物质筛选:原理与应用

刘梦晨, 范庆, 周鹤峰, 阳小燕, 汪泽, 尹田鹏, 何希瑞, 崔国祯

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山西大学学报(自然科学版) ›› 2025, Vol. 48 ›› Issue (02) : 314-321. DOI: 10.13451/j.sxu.ns.2024173

基于网络邻近度的活性物质筛选:原理与应用

  • 刘梦晨, 范庆, 周鹤峰, 阳小燕, 汪泽, 尹田鹏, 何希瑞, 崔国祯
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摘要

活性物质的筛选在疾病预防和治疗中具有至关重要的作用。然而,传统方法在复杂疾病药物筛选时存在一定的局限性。随着网络医学的发展,基于蛋白质相互作用网络的虚拟筛选技术为活性物质的发现提供了新的途径。基于网络医学框架的网络邻近度计算方法表现尤为突出。本文介绍了新开发的计算平台ZMUpredict,该平台基于网络邻近度原理,整合疾病基因和活性物质的靶点,能够快速预测候选活性物质对疾病的潜在疗效。用户提交活性物质靶点和疾病基因集后,平台能够自动生成分析结果,并通过Z值和P值量化活性物质靶点与疾病模块之间的网络距离,从而评估其治疗潜力。此外,该平台还支持联合用药分析和子网络提取功能。本文通过以山茶油活性成分筛选为例,展示了该平台在天然产物和中药研究中的应用前景。ZMUpredict为研究人员提供了便捷的虚拟筛选工具,即使不具备编程技能的用户也能利用网络医学方法开展高效的活性物质虚拟筛选,为复杂疾病的药物发现提供强有力的技术支持。

关键词

网络医学 / 网络邻近度 / 活性物质筛选 / 老药新用 / 中药

中图分类号

R965.1

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刘梦晨, 范庆, 周鹤峰, 阳小燕, 汪泽, 尹田鹏, 何希瑞, 崔国祯. 基于网络邻近度的活性物质筛选:原理与应用. 山西大学学报(自然科学版). 2025, 48(02): 314-321 https://doi.org/10.13451/j.sxu.ns.2024173

基金

贵州省科技计划项目(黔科合支撑[2023]一般071); 广东省普通高校创新团队项目(2024KCXTD005)

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