基于理性设计策略提高呕吐毒素解毒酶DepB的催化活性

周慧敏, 牛家峰, 池慧兵, 马斌, 朱萍, 陆兆新, 吕凤霞

南京农业大学学报 ›› 2024, Vol. 47 ›› Issue (06) : 1168-1177.

基于理性设计策略提高呕吐毒素解毒酶DepB的催化活性

  • 周慧敏, 牛家峰, 池慧兵, 马斌, 朱萍, 陆兆新, 吕凤霞
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摘要

[目的]呕吐毒素(DON)广泛存在于粮谷类原料及其制品中,对人和动物的健康都造成严重危害。然而,现有呕吐毒素解毒酶DepB存在种类少、催化性能差等问题,限制了其在食品加工和饲料中的应用。本研究采用理性设计策略对呕吐毒素解毒酶DepB进行分子改造,以提高DepB的催化活性。[方法]通过对底物10?范围内的氨基酸残基进行丙氨酸和甘氨酸扫描,确定突变“热点”氨基酸残基。随后,采用定点饱和突变和组合突变技术筛选得到催化活性显著提高的突变酶,并对其进行三维结构模拟和分子动力学模拟,分析其催化活性提高的分子机制。[结果]通过筛选获得了催化活性显著提高的三点突变酶A289V/A227R/S54N,该酶比活力为335.77 U·mg-1,是野生型DepB的2.25倍。三点突变酶的Km值由95.11μmol·L-1下降到58.33μmol·L-1,kcat/Km值由5.99 mmol-1·L·s-1提高至16.94 mmol-1·L·s-1,亲和力和催化效率均显著提高。通过三维结构模拟和分子动力学模拟分析,发现空间位阻减小、静电相互作用增强、酶-底物-辅酶结合自由能降低是其催化活性提高的分子机制。[结论]基于理性设计策略提高了DepB的催化活性,强化了DepB的适用性能,为呕吐毒素解毒酶的分子改造及其在食品加工和饲料中的应用提供依据。

关键词

呕吐毒素解毒酶 / DepB / 催化活性 / 理性设计 / 分子机制

中图分类号

S859.8 / TS201.3 / TS201.6

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周慧敏, 牛家峰, 池慧兵, 马斌, 朱萍, 陆兆新, 吕凤霞. 基于理性设计策略提高呕吐毒素解毒酶DepB的催化活性. 南京农业大学学报. 2024, 47(06): 1168-1177

基金

国家自然科学基金项目(32272267)

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