基于定向进化技术提高呕吐毒素解毒酶DepA的催化活性

李越, 池慧兵, 牛家峰, 马斌, 周慧敏, 朱萍, 吕凤霞

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南京农业大学学报 ›› 2024, Vol. 47 ›› Issue (04) : 750-759.

基于定向进化技术提高呕吐毒素解毒酶DepA的催化活性

  • 李越, 池慧兵, 牛家峰, 马斌, 周慧敏, 朱萍, 吕凤霞
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摘要

[目的]呕吐毒素(deoxynivalenol, DON)C3位羟基的异构化是生物脱毒的关键部位,其中DepA作为DON生物转化中第一步关键限速酶,存在催化活性低的问题,限制了其在食品及饲料加工领域中的应用。本文旨在通过定向进化技术对DepA进行分子改造,以期获得催化活性显著提高的突变酶,提高其工业化应用的潜力。[方法]通过易错PCR和DNA shuffling相结合的方法,构建突变文库,经高通量筛选后,对催化活性明显提高的突变体进行酶学性质表征。同时,采用分子动力学模拟和三维结构模拟分析,探究突变酶催化活性提高的分子机制。[结果]成功筛选到突变酶S2、S10和S12,与野生型相比,其比活力分别提高207%、293%和258%。动力学参数结果显示,突变酶S2、S10和S12的K_m值分别为56.89、27.00和40.65μmol·L~(-1),是野生型的91.7%、43.5%和65.5%;k_(cat)/K_m值分别为327.30、576.67和380.07 L·mmol~(-1)·s~(-1),是野生型的1.25、2.20和1.45倍,相比野生型,突变酶亲和力和催化效率均显著提高。此外,分子动力学模拟和三维结构模拟分析结果表明,柔性增加、底物DON的进攻距离缩短、氢键增加、疏水性增加和远端效应是导致其催化活性提高的主要原因。[结论]本研究通过易错PCR和DNA shuffling相结合的定向进化策略有效提高了呕吐毒素解毒酶DepA的催化活性,为其工业化应用提供试验依据。

关键词

呕吐毒素解毒酶 / 定向进化 / 催化活性 / 分子动力学模拟

中图分类号

TS201.6 / TQ426.97

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李越, 池慧兵, 牛家峰, 马斌, 周慧敏, 朱萍, 吕凤霞. 基于定向进化技术提高呕吐毒素解毒酶DepA的催化活性. 南京农业大学学报. 2024, 47(04): 750-759

基金

国家自然科学基金项目(32272267)

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