[目的]本文旨在探究健康与罹患根腐病三七内生真菌群落特征差异及在不同植株部位的分布特征与随生长年限的变化规律。[方法]选取1年、2年生健康与罹患根腐病的三七植株，采用组织分离法对其根、茎部位的内生真菌进行分离，基于形态特征和ITS序列分析对分离得到的菌株进行分类鉴定，并对内生真菌群落组成及多样性特征进行分析。[结果]共分离获得966株内生真菌，经鉴定隶属于3门、5纲、14目、25科、31属。从菌株分离数及分离率看：罹病植株>健康植株，2年生>1年生，根部>茎部。健康和罹病三七的可培养内生真菌组成存在明显差异，其中曲霉属、耙齿菌属、毛壳属和青霉属在健康三七内生真菌群落中占主导，而镰刀菌属、曲霉属、篮状菌属、毛壳属和木霉属是罹病三七内生真菌的优势属。植株部位对三七内生真菌群落组成具有明显影响，其中罹病三七根部镰刀菌属的分离频率高达52%,显著高于其茎部的11.2%,且在罹病三七根部大量分离到木霉属和篮状菌属等有益真菌，其分离频率分别为11.0%和14.5%,而三七茎部内生真菌群落多样性、丰富度和均匀度均高于根部。此外，随着生长年限的增加，三七内生真菌群落的发育更加完善，健康和罹病三七内生真菌群落组成及多样性特征也随之变化，其中尖孢镰刀菌和腐皮镰刀菌在罹病三七植株中的分离频率大幅增加，达到14.5%和32.9%。健康三七内生真菌多样性、丰富度和均匀度随生长年限增加逐渐上升，而罹病三七内生真菌多样性和均匀度逐渐降低。[结论]三七植株内生真菌多样性丰富，健康和罹病三七可培养内生真菌定殖数量及群落组成具有显著差异，且植株部位与生长年限均对三七可培养内生真菌群落特征具有显著影响。