[目的]本文旨在利用航天诱变技术，选育获得金针菇特色优质种质资源。[方法]对金针菇菌株F3-1进行航天诱变处理，通过拮抗试验、分子标记试验和活性物质测定等对航天诱变菌株进行筛选鉴定及遗传变异多样性分析，并筛选活性物质含量高的菌株。[结果]拮抗试验初筛获得7株与出发菌株存在拮抗现象的变异株。分子标记(ISSR、RAPD、SRAP)聚类分析结果表明，7个诱变菌株与出发菌株的遗传相似系数为0.694～0.962,且在遗传相似系数为0.800时可分为3个类群。诱变菌株与出发菌株的菌丝生长速度、生物量、总酚、类黄酮、多糖和麦角硫因等指标的变异系数为7.68%～38.97%,遗传多样性指数H′为1.53～2.00。其中，多糖含量的变异系数最高，受诱变影响大；总酚的遗传多样性指数最大，诱变类型丰富。生物学特性聚类分析显示，在遗传距离为3.16时分为3个类群。最终筛选获得2株活性物质含量高的菌株(T2和T5),其中T2菌株生长速度、生物量和活性物质等均优于出发菌株，而T5菌株主要表现为高多糖含量菌株，其多糖含量比出发菌株提高114.70%(P<0.01)。[结论]航天诱变处理的金针菇菌株存在丰富的遗传变异多样性，是新品种选育的优异种质资源。