[目的]孵化后期热处理能够在一定程度上提高肉鸡的耐热性，而骨骼肌和肝脏线粒体功能及温敏瞬时电位(transient receptor potential, TRP)离子通道与机体耐热性密切相关。因此，本试验旨在研究孵化后期热处理(thermal manipulation, TM)对雏鸡骨骼肌和肝脏温敏TRP离子通道及线粒体功能的影响。[方法]选取240枚AA肉鸡种蛋随机分为3组(每组8个重复，每重复10枚种蛋):CON组，37.5℃孵化；TM1组，在孵化期第16～18天39.5℃热处理3 h·d~(-1);TM2组，在孵化期第16～18天41.5℃热处理3 h·d~(-1)。出雏后测定1日龄直肠温度，检测胸肌、腿肌和肝脏组织相关基因表达水平。[结果]与CON组相比，孵化后期热处理显著降低了1日龄雏鸡的直肠温度(P<0.01),TM1组雏鸡腿肌器官指数显著增加(P<0.05)。与CON组相比，TM2组雏鸡胸肌的avUCP基因表达水平显著降低(P<0.01),COXⅣ(P<0.05)、Tfam(P<0.01)、PGC1α(P<0.05)、ATP5B(P<0.01)和IDH3α(P<0.01)基因表达水平均显著增加，TRPV1、TRPV2和TRPV3基因表达水平均显著降低(P<0.05),SERCA1基因表达水平显著增加(P<0.01)。与CON组相比，TM2组雏鸡腿肌的avUCP基因表达水平显著降低(P<0.01),ATP5B基因表达水平显著增加(P<0.05);TM2组雏鸡肝脏组织的Tfam和SERCA1基因表达水平显著增加(P<0.05)。相关性分析结果显示，温敏TRP基因表达水平与线粒体经典产热基因avUCP和avANT表达呈正相关关系，与线粒体氧化磷酸化功能相关基因表达水平呈负相关关系。[结论]孵化后期热处理可通过降低1日龄雏鸡胸肌的温敏TRP基因和线粒体产热相关基因表达水平水平，增加线粒体生物发生及氧化磷酸化功能相关基因表达水平，引起线粒体热适应性变化。