靶向鸡糖皮质激素受体基因的microRNA预测与鉴定

赵敏蝶, 刘杰, 赵茹茜

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南京农业大学学报 ›› 2024, Vol. 47 ›› Issue (03) : 489-496.

靶向鸡糖皮质激素受体基因的microRNA预测与鉴定

  • 赵敏蝶, 刘杰, 赵茹茜
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摘要

[目的]本文旨在预测和筛选靶向调控鸡糖皮质激素受体(glucocorticoid receptor, GR)表达的microRNA。[方法]用TargetScan、PicTar和miRDB软件分别预测靶向鸡GR 3′UTR microRNA并取交集;构建包含鸡GR 3′UTR的重组质粒及突变质粒,通过双荧光素酶试验鉴定microRNA和鸡GR 3′UTR的靶向性;用TargetScan和miRDB软件分别预测候选microRNA的靶基因,用DAVID软件对预测出的共同靶基因进行GO功能分析;用Western blot检测过表达候选microRNA对鸡DF1细胞GR蛋白表达的影响。[结果]miR124-3p、miR142-3p、miR204/211、miR183、miR18-5p和miR181a/181b是3种软件预测靶向GR 3′UTR的交集microRNA;双荧光素酶试验结果表明miR142-3p、miR204/211和miR18-5p靶向结合GR 3′UTR。2种软件预测3个候选microRNA的靶基因中都有GR且富集分子功能不同;在DF1细胞中过表达3个候选microRNA后,miR142-3p和miR204/211显著降低GR蛋白的表达水平(P<0.05)。[结论]miR142-3p、miR204/211和miR18-5p靶向结合鸡GR 3′UTR,且miR142-3p和miR204/21可以降低鸡DF1细胞中GR蛋白的表达水平。

关键词

/ 糖皮质激素受体 / microRNA / 靶向基因

中图分类号

S831.2

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赵敏蝶, 刘杰, 赵茹茜. 靶向鸡糖皮质激素受体基因的microRNA预测与鉴定. 南京农业大学学报. 2024, 47(03): 489-496

基金

国家自然科学基金项目(32272962,31972638); “十四五”国家重点研发计划项目(2022YFD1300401)

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