[目的]利用马克斯克鲁维酵母(Kluyveromyces marxianus)系统高效表达鸭腺病毒3型(DAdV-3)Fiber-2蛋白，用于制备安全、高效、低成本的鸭腺病毒亚单位疫苗。[方法]以食品安全级的马克斯克鲁维酵母为宿主，对DAdV-3 Fiber-2蛋白进行重组表达，建立高密度发酵和纯化工艺，获得目的蛋白并制备成亚单位疫苗，然后进行动物试验。试验分为低剂量组(琼扩效价1∶64,每羽34μg)、高剂量组(1∶128,每羽68μg)、空白组和攻毒对照组，在免疫后第10天和第21天采血检测血清中的抗体水平，攻毒7 d后采肛拭子检测排毒量；通过抗体水平和排毒量评估该亚单位疫苗的保护效果。[结果]通过SDS-PAGE、Western blot和琼脂糖凝胶扩散(AGP)试验验证fiber-2基因在酵母中成功表达。重组菌经高密度发酵，目的蛋白纯化后检测其表达水平，琼扩效价可达1∶128。动物试验结果显示，疫苗免疫组在免疫后第21天所测得血清中的抗体水平显著高于空白组；疫苗免疫组在攻毒7 d后的排毒量显著低于攻毒对照组。[结论]DAdV-3 Fiber-2蛋白能在马克斯克鲁维酵母细胞中进行高效表达，并且用该蛋白制备的亚单位疫苗对鸭3型腺病毒具有一定的保护作用。