基因体甲基化在舌粘膜癌变中的变化

刘华, 岳万远, 邵帅, 孙家平, 杨莹, 代晓明

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昆明医科大学学报 ›› 2024, Vol. 45 ›› Issue (07) : 23-29.

基因体甲基化在舌粘膜癌变中的变化

  • 刘华, 岳万远, 邵帅, 孙家平, 杨莹, 代晓明
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摘要

目的 了解舌粘膜癌变中基因体甲基化的差异表达基因。方法 用浓度50 mg/L的4-硝基喹啉-1-氧化物(4NQO)诱导C57BL/6小鼠舌癌。基因芯片和甲基化DNA免疫沉淀测序(MeDIP-Seq)检测0周、12周、28周(代表正常、癌前、癌变)的舌粘膜的基因表达和基因组DNA甲基化。在人正常舌粘膜和癌前病变组织中用qRT-PCR和飞行质谱检测泛素羧基水解酶CYLD的mRNA表达和基因体甲基化。结果 正常、癌前和舌癌3组间基因体MeDIP-score(mean±s)分别是(5.58±14.80)、(5.79±13.35)、(5.83±17.25),差异无统计学意义(H=100.75,P> 0.05)。3组间145个差异表达基因伴基因体甲基化改变。CYLD在人癌前病变组织中表达降低伴有基因体甲基化降低(P <0.05)。结论 舌粘膜癌变有多个基因体甲基化异常的差异表达基因,CYLD在人癌前病变中低表达可能与基因体甲基化有关。

关键词

舌癌 / 动物模型 / 甲基化 / 基因体 / 差异表达基因

中图分类号

R739.86

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刘华, 岳万远, 邵帅, 孙家平, 杨莹, 代晓明. 基因体甲基化在舌粘膜癌变中的变化. 昆明医科大学学报. 2024, 45(07): 23-29

基金

云南省科技厅-昆明医科大学应用基础研究联合专项基金资助项目[202001AY070001-253;2018FE001(-216)]

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