卵巢癌脂质代谢相关基因预后模型的构建及免疫浸润分析

王兴粉, 邓玥, 杨丽华

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昆明医科大学学报 ›› 2024, Vol. 45 ›› Issue (04) : 17-25.

卵巢癌脂质代谢相关基因预后模型的构建及免疫浸润分析

  • 王兴粉, 邓玥, 杨丽华
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摘要

目的 构建卵巢癌(ovarian carcer,OC)脂质代谢相关预后模型,探讨脂质代谢相关生物标志物及免疫细胞浸润程度在OC预后预测中的作用。方法 下载TCGA数据库中OC样本转录组数据和临床数据,MSig DB数据库获取脂质代谢相关基因(LMRGs),caret包将样本按1∶1随机分为训练集与验证集,单因素Cox分析得到与OC预后显著相关的LMRGs,LASSO-Cox分析筛选模型基因以构建预后模型,Kaplan-Meier曲线及受试者工作特征(ROC)曲线评估预后模型效能,并进行TCGA内部验证。最后构建列线图并采用CIBERSORT算法进行免疫浸润分析。结果 构建了1个8基因的OC预后模型,生存分析显示高风险组与低风险组预后差异有统计学意义(P <0.05)。AUC提示该模型具有中等程度预测效能;多因素Cox分析显示LMrisk是OC患者的独立预后因素(P <0.001);免疫浸润分析显示LMrisk与OC免疫相关。结论 OC患者预后模型可作为1种新的独立预后评估手段,LMrisk可作为稳健的预后生物标志物,可能具有进一步临床应用的价值。

关键词

卵巢癌 / 脂质代谢 / 预后模型 / 免疫细胞浸润

中图分类号

R737.31

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王兴粉, 邓玥, 杨丽华. 卵巢癌脂质代谢相关基因预后模型的构建及免疫浸润分析. 昆明医科大学学报. 2024, 45(04): 17-25

基金

国家自然科学基金资助项目(82360579);; 云南省“万人计划”名医专项基金资助项目(YNWR-MY-2019-037);; 昆明医科大学卵巢癌临床及基础研究科技创新团队(CXDT202008);; 昆明医科大学第二附属医院对外合作基金资助项目(2022dwhz06);; 云南省科技厅-昆明医科大学应用基础研究联合专项基金资助项目(202401AY070001-053)

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