两类蛋白质粗粒化模型

史绍康, 赵莉, 吕中元

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吉林大学学报(理学版) ›› 2025, Vol. 63 ›› Issue (01) : 182-190. DOI: 10.13413/j.cnki.jdxblxb.2024471

两类蛋白质粗粒化模型

  • 史绍康, 赵莉, 吕中元
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摘要

基于在分子层面探究蛋白质折叠、组装和相分离等行为的动力学细节特征是目前该领域研究的重点和难点,而粗粒化模型已成为应对该问题的关键策略.综述蛋白质粗粒化模型的发展历程,介绍两种常用的粗粒化模型,并阐述其建模方法、势能函数以及在实际生物体系中的应用.通过展示这些模型在复杂蛋白质体系模拟中的应用优势,揭示粗粒化模型在显著减少计算资源消耗方面的独特价值,及其在推进大规模蛋白质动力学过程研究中的潜力与重要意义.

关键词

蛋白质 / 粗粒化 / 多尺度 / 分子动力学模拟

中图分类号

Q51

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史绍康, 赵莉, 吕中元. 两类蛋白质粗粒化模型. 吉林大学学报(理学版). 2025, 63(01): 182-190 https://doi.org/10.13413/j.cnki.jdxblxb.2024471

基金

国家自然科学基金(批准号:22473048)

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