Hedgehog (HH)信号通路参与脊椎动物和无脊椎动物的诸多发育过程，包括胚胎发生、干细胞更新、组织再生、肿瘤的发生发展及化疗耐药等。HH信号通路中关键组分的过度激活和异常表达与多种恶性肿瘤的发生发展有关。磷酸化修饰在正常细胞的蛋白质活性与功能调节中发挥重要作用，并且磷酸化-去磷酸化级联反应失调与肿瘤密切相关。HH信号通路的异常激活也与蛋白质磷酸化修饰有关，其调控的复杂机制还需进一步探索。本文对恶性肿瘤中HH信号通路以及蛋白磷酸化修饰的研究进展进行综述，重点讨论磷酸化修饰对HH信号通路活性的调控作用及其对恶性肿瘤发生发展的影响，以期为靶向磷酸酶/去磷酸酶药物的深入研发和临床应用提供理论基础。