为深入了解牦牛乳脱脂前后的蛋白功能差异，本实验基于4D非标（4D LFQ-Label-free）蛋白质组定量技术对全脂牦牛乳和脱脂牦牛乳进行蛋白组学分析。结果表明脱脂前后牦牛乳蛋白在数量上共有365种受到影响，其中231种蛋白的功能被上调，134种蛋白的功能被下调；主要被上调的蛋白功能为：核糖体、c GMP-PKG信号通路、缝隙连接、长期抑郁、胰岛素分泌、脂肪细胞中脂肪分解的调节等通路；主要被下调的蛋白功能为：糖酵解/糖异生、淀粉和蔗糖代谢、n-聚糖生物合成、各种类型的N-聚糖生物合成、溶酶体；除此之外脱脂后的牦牛乳还会不同程度上影响内质网中的蛋白质加工、补体和凝血级联反应、肾素-血管紧张素系统等功能。