目的：系统评估真菌病临床实践指南/共识的方法学质量，为未来真菌病领域内指南/共识的制订提供参考依据。方法：检索Medline(via PubMed)、Embase、中国知网、万方数据知识服务平台、中国生物医学文献数据库、中国临床指南文库网和中华医学知识库指南文库等相关数据库和相关网站中真菌病指南和专家共识，检索时间为2023年1月至2024年12月。由2名评价员通过一致性评价后，采用临床指南研究与评价系统Ⅱ（AGREEⅡ）对纳入的指南及共识进行方法学质量评价并分析。结果：最终纳入22部指南/共识，其中8部评为A级别（建议推荐），14部评为B级（修改后可推荐）。AGREEⅡ评价6个领域得分率分别是：范围和目的 8.21%±1.52%、参与人员65.53%±0.79%、严谨性68.94%±0.23%、清晰性80.81%±0.45%、应用性6.35%±0.52%、独立性67.99%±4.09%。指南在严谨性方面优于共识（P<0.01）。结论：真菌病诊疗指南和专家共识的方法学质量有关参与人员、严谨性、应用性和独立性方面均有待进一步提高，指南/共识制订需严格按照AGREEⅡ要求明确利益冲突。