目的：探究毛郁金根茎内生真菌的种类及其体外抗心肌细胞缺氧/复氧（H/R）损伤的活性。方法：采用组织块贴壁法提取、分离、纯化毛郁金根茎内生真菌，PDB发酵培养，MTT法对粗提物进行抗心肌细胞H9C2 H/R损伤的保护作用筛选。结果：本研究从毛郁金根茎中分离并鉴定出23株内生真菌，其中17株鉴定到种，6株鉴定到属；11株内生真菌的粗提物在一定浓度范围内无明显细胞毒性；11株无明显细胞毒性的内生真菌中有2株对H9C2心肌细胞H/R损伤具有保护作用（P<0.05）。结论：本研究分离的内生真菌的活性结果与毛郁金根茎体外抗H/R作用类似，为进一步从该植物内生真菌中寻找抗心肌损伤保护作用的化学成分提供了可行性依据。