目的：利用生物信息学方法筛选并分析慢性阻塞性肺疾病（慢阻肺）与焦亡相关的关键基因。方法：首先对慢阻肺数据集GSE38974进行差异分析，得到差异基因后与焦亡相关基因取交集，最终获取焦亡相关的差异基因（DEprGs）；对DEprGs进行GO和KEGG功能富集分析以及PPI分析；应用Cytoscape软件及其插件cytohubba的4种算法分析PPI的结果并取交集得出关键基因；用GSE38974、GSE47460数据集再次验证关键基因后筛选出最有意义的核心基因；12只C57BL/6小鼠分别于空气和烟草烟雾暴露24周后采用HE染色观察小鼠肺组织病理改变，并运用实时荧光定量聚合酶链式反应（RT-qPCR）在动物模型中验证最关键基因的差异性表达。结果：GSE38974与焦亡相关基因取交集共得到32个DEprGs,PPI进一步分析后得到7个关键基因；使用GSE38974及GSE47460两个数据集再次验证7个关键基因，在两个数据集中同时表达且有显著差异（P<0.01）的核心基因仅有2个，即NAIP、HDAC6，其中NAIP上调，HDAC6下调；HE染色可见烟草烟雾暴露组（烟熏组）小鼠较空气暴露组（空气组）肺泡变薄且断裂融合，肺泡腔明显扩大，炎症细胞浸润明显，烟熏组小鼠平均肺泡间距明显大于空气组（P<0.05）；生物信息学分析的结果与核心基因实验验证结果一致，且相关性分析显示NAIP、HDAC6与小鼠的平均肺泡间距相关（P<0.05）。结论：在慢阻肺中，细胞焦亡相关基因NAIP高表达，可能参与慢阻肺的发生和发展；而HDAC6低表达，可能是潜在的保护因素。