大型活动散场时段的短时大客流需求具有空间分布失衡性，易造成城市轨道交通站台出现乘客聚集现象，不仅影响乘客乘车的舒适度，还存在安全事故隐患。为解决该问题，将乘客进站与列车运行时间离散化，以乘客最佳进站人数与列车运行长短交路作为决策变量，基于客流演化与列车运行的动态关系，建立以乘客总等待时间和列车运行时间最小化为目标的多站联合限流与长短交路开行方案协同优化模型，并运用蜂群优化算法进行模型求解。以某轨道交通线路为例，验证模型的有效性。结果表明，与常规运营策略相比，协同优化策略下运营成本减少了5.3%,乘客等待时间减少了19.2%,实现了对大型活动背景下车站短时大客流的有效控制。