人类肠道拥有复杂而丰富的菌群，肠道菌群参与营养吸收、免疫防御、调节代谢等生理功能。肠道微生物群落的变化涉及许多疾病如缺血性卒中、帕金森病的发生发展，甚至与疾病的严重程度相关。而针刺作为中国传统医学中重要的组成部分，被证实对肠道菌群具有调节作用。针刺可以通过调节肠道菌群的群落多样性、丰度调控宿主代谢、免疫应答，影响相关疾病的发展。肠道微生物群靶向治疗相关疾病的机制和模式仍需继续探索。