基于TCGA数据库探究SERPINA5在前列腺癌中的表达及临床意义

陶润, 李文永, 关翰, 李俊, 邓硕, 张家俊

蚌埠医科大学学报 ›› 2024, Vol. 49 ›› Issue (03) : 335-339+343. DOI: 10.13898/j.cnki.issn.1000-2200.2024.03.012

基于TCGA数据库探究SERPINA5在前列腺癌中的表达及临床意义

  • 陶润, 李文永, 关翰, 李俊, 邓硕, 张家俊
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摘要

目的:研究前列腺癌中关键基因的差异化表达,为前列腺癌的诊疗提供新的生物治疗靶点和理论依据。方法:从美国癌症基因组图谱(TCGA)中下载前列腺癌的相关基因数据,利用R软件筛选出在前列腺癌组织和癌旁组织中差异化表达的基因,并进行富集分析。利用STRING 11.0构建差异基因所表达蛋白的互作网络图,并通过Cytoscape_v3.7.1进一步筛选Hub基因,通过Oncomine数据库对Hub基因在前列腺癌中的表达进行验证得到关键基因,随后利用R软件对关键基因与临床数据进行统计分析,最终利用在线工具GEPIA对关键基因进行生存分析。结果:总共得到551个样本(其中癌旁组织样本52个,癌组织样本499个),筛选后得到463个差异基因,其中呈现上调趋势的基因共265个,下调198个。富集分析后发现这些基因主要富集在顶体反应的调节、三酰甘油代谢过程,PPAR信号通路等,进一步筛选后得到10个Hub基因,与Oncomine数据库联合验证后得到关键基因SERPINA5,进行临床分析发现前列腺癌病人的SERPINA5的表达水平与肿瘤分化程度、TNM分期以及无病生存率有关(P<0.05),而与年龄、人种以及总生存率的差异无关(P>0.05)。结论:前列腺癌中存在大量差异基因可能对疾病的发生发展起到影响作用,其中SERPINA5也许可以作为前列腺癌早期筛查标志物或治疗的生物靶点,为前列腺癌的预防与治疗带来新的方案以及研究方向。

关键词

前列腺肿瘤 / 癌症基因组图谱 / Oncomine数据库

中图分类号

R737.25

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陶润, 李文永, 关翰, 李俊, 邓硕, 张家俊. 基于TCGA数据库探究SERPINA5在前列腺癌中的表达及临床意义. 蚌埠医科大学学报. 2024, 49(03): 335-339+343 https://doi.org/10.13898/j.cnki.issn.1000-2200.2024.03.012

基金

蚌埠医学院自然科学研究重点项目(BYKY2019035ZD);; 安徽省高校自然科学研究重点项目(KJ2021A0819)

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