植物IPP基因的生物信息学分析

喻心怡, 冀慧玥, 路萍萍, 周嘉裕, 廖海

植物研究 ›› 2024, Vol. 44 ›› Issue (05) : 774-782.

植物IPP基因的生物信息学分析

  • 喻心怡, 冀慧玥, 路萍萍, 周嘉裕, 廖海
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摘要

异戊烯基焦磷酸异构酶(IPP)催化异戊烯焦磷酸与二甲基丙烯基焦磷酸(DMAPP)的可逆异构化反应,对下游萜类产物的合成发挥重要作用。该研究利用生物信息学方法,从稻(Oryza sativa)与拟南芥(Arabidopsis thaliana)等单、双子叶植物基因组中鉴定获得31条IPP基因。系统进化树将IPP分为3簇,其中单子叶植物单独形成一簇,同簇的IPP成员具有相似的结构域,可能执行相似的生物学功能;以稻与拟南芥IPP基因为代表,顺式调控元件分析显示它们含有干旱等响应元件;定量PCR结果显示,稻与拟南芥IPP转录水平的表达模式较为多样化。研究结果为系统认识IPP基因的生物学作用及可能的应用研究提供了理论依据。

关键词

异戊烯基焦磷酸异构酶 / 生物信息学 / 干旱胁迫 / 脱落酸 / 表达模式

中图分类号

Q943.2

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喻心怡, 冀慧玥, 路萍萍, 周嘉裕, 廖海. 植物IPP基因的生物信息学分析. 植物研究. 2024, 44(05): 774-782

基金

国家自然科学基金项目(32270410)

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