目的 探讨不同NIHSS评分缺血性脑卒中（CIS）患者血清组织蛋白酶S(CatS)、视锥蛋白样蛋白-1(VILIP-1)、胱抑素C(CysC)水平变化及其与疾病转归的相关性。方法 选取2021-01—2023-01南阳市中心医院收治的143例CIS患者为研究对象，根据入院时NIHSS评分分为低分组（43例，NIHSS评分<4分）、中分组（68例，NIHSS评分4～15分）和高分组（32例，NIHSS评分>15分）。比较3组入院时血清CatS、VILIP-1、CysC水平，分析其与NIHSS评分的相关性，比较不同疾病转归患者血清各指标水平，偏回归分析CIS患者转归不良的影响因素，ROC分析各指标联合检测对CIS患者转归不良的预测价值。结果 入院时低分组血清CatS、VILIP-1、CysC水平分别为（53.18±6.74） ng/L、（4.57±1.38）μg/L、（1.08±0.32） mg/L，低于中分组[（76.53±9.25） ng/L、（9.63±2.44）μg/L、（1.74±0.39） mg/L]和高分组[（98.44±8.61） ng/L、（16.72±3.55）μg/L、（2.53±0.47） mg/L]，各指标水平与NIHSS评分均呈正相关（P<0.05）。治疗1周、2周后转归不良患者血清CatS、VILIP-1、CysC水平[治疗1周后：（73.35±8.44） ng/L、（9.25±2.44）μg/L、（1.73±0.33） mg/L；治疗2周后：（70.96±9.02） ng/L、（8.74±2.13）μg/L、（1.71±0.30） mg/L]高于转归良好患者[治疗1周后：（55.87±6.29） ng/L、（6.15±2.03）μg/L、（1.01±0.31） mg/L；治疗2周后：（31.95±6.24） ng/L、（2.86±0.74）μg/L、（0.64±0.19） mg/L](P<0.05)。治疗1周、治疗2周后血清CatS、VILIP-1、CysC水平为CIS患者转归不良的危险因素，联合检测预测CIS患者转归不良的AUC分别为0.784、0.838。结论 血清CatS、VILIP-1、CysC水平与CIS患者神经功能损伤程度及疾病转归密切相关，联合检测可作为临床判断神经功能损伤程度、预测转归情况的有效依据。