目的 探讨益生菌肠内营养支持联合经颅磁刺激在脑卒中后吞咽障碍康复中的临床应用效果。方法 选取2019-01—2022-12上海中医药大学附属第七人民医院收治的98例脑卒中吞咽障碍患者，分为观察组和对照组各49例。对照组实施经颅磁刺激疗法+营养支持干预，观察组辅助应用益生菌肠内营养干预。对比2组间疗效、吞咽功能、营养健康状况、免疫功能、肠道屏障功能。结果 观察组临床疗效优于对照组(P<0.05)。治疗后，观察组洼田饮水试验(KWST)、功能性吞咽障碍量表(FDS)、EAT-10评分均低于对照组(P<0.05)，血红蛋白(Hb)、白蛋白(ALB)、前白蛋白(PAB)水平均高于对照组(P<0.05)，免疫球蛋白A(IgA)、免疫球蛋白G(IgG)、免疫球蛋白M(IgM)水平均高于对照组(P<0.05),ET、DAO、D-LA低于对照组(P<0.05)。结论 益生菌肠内营养支持结合经颅磁刺激对脑卒中吞咽障碍有较好干预效果，能提高吞咽功能和营养水平，提升免疫水平，提高患者肠黏膜屏障功能。