目的 了解医疗机构住院患者丙型肝炎病毒（HCV）感染情况及变化趋势，为制定HCV感染防控策略提供参考依据。方法 对2020年上报至全国医院感染监控网医院感染横断面调查资料中HCV感染监测结果进行汇总分析，HCV阳性为血清抗-HCV阳性或HCV RNA阳性，并与2003年调查结果进行比较。结果 2020年1 573所医院调查住院患者1 071 368例，其中738 535例患者进行了HCV相关检测，4 014例存在HCV感染，检测率为68.93%,HCV阳性率为0.54%。男性患者HCV阳性率为0.60%,女性患者为0.48%,两者比较差异有统计学意义（χ²=47.18,P<0.001）。年龄段以50～<60岁组HCV阳性率最高（0.76%）,其次为40～<50岁组，HCV阳性率为0.71%,各年龄段比较差异有统计学意义（χ²=696.74,P<0.001）。2003年调查住院患者91 113例，35 145例进行HCV相关检测，检测率为38.57%,775例存在HCV感染，HCV阳性率为2.21%。2020年不同规模医院HCV阳性率为0.46%～0.63%,以医院床位数600～899张者最高，不同规模医院患者HCV阳性率比较，差异有统计学意义（χ²=35.34,P<0.001）。2020年有12个省/直辖市/自治区HCV相关检测患者人数>10 000例，HCV阳性率为0.19%～0.81%,以海南省最高；不同科室HCV阳性率为0.06%～0.82%,以儿科HCV阳性率最低，内科HCV阳性率最高。2003、2020年HCV阳性率均以感染病科最高，分别为7.95%、3.48%,2003年其次为整形科（7.72%）、消化科（3.77%）、肾病科（3.57%）、综合重症监护病房（ICU,3.10%）,2020年其次为消化科（1.35%）、肾病科（1.18%）、内分泌科（0.91%）、综合ICU（0.79%）。结论 与2003年相比，2020年HCV阳性率明显下降。HCV感染患者主要分布在感染病科，其次为消化科、肾病科及综合ICU,HCV感染阳性率存在性别、年龄、地域的差异。