患儿1，女，12 d，因发热、咳嗽、呼吸困难、感染指标增高就诊，需呼吸支持治疗，血液及肺泡灌洗液宏基因组二代测序（metagenomic next-generation sequencing, mNGS）示嗜肺军团菌（Legionella pneumophila,LP），诊断为LP肺炎、LP败血症，予红霉素15 d、阿奇霉素5 d治疗痊愈出院。患儿2，女，11 d，因呼吸困难、发热、感染指标增高伴多器官功能损伤就诊，需机械通气，血及脑脊液mNGS示LP，诊断为LP肺炎、LP败血症、LP颅内感染，予红霉素19 d治疗痊愈出院。新生儿LP肺炎无特异临床症状，首选抗菌药物为阿奇霉素，对不明原因新生儿重症肺炎使用mNGS可早期明确诊断。[中国当代儿科杂志，2024,26 (9):986-988]