目的 探讨母亲MTR基因多态性及其与围孕期叶酸补充的交互作用与子代室间隔缺损（ventricular septal defect, VSD）的关联。方法 采用病例对照研究，招募426例1岁以内VSD患儿母亲和740例同年龄段健康婴儿母亲。通过问卷调查收集母亲相关暴露信息，并采集其血液标本进行基因多态性检测。采用多因素logistic回归和逆概率加权法处理后logistic回归分析位点与VSD的关联。使用叉生分析和logistic回归分析探讨位点与叶酸补充间的相加和相乘交互作用。结果 母亲MTR基因rs6668344位点CT和TT型增加了子代对VSD的易感性（P<0.05）。rs3768139位点GC和CC型、rs1050993位点AG和GG型、rs4659743位点AT和TT型、rs3768142位点GG型、rs3820571位点GT和TT型与VSD发生风险降低有关（P<0.05）。rs6668344位点变异与叶酸补充对VSD存在拮抗相乘交互作用（P<0.05）。结论 母亲MTR基因多态性与子代VSD发生显著相关。rs6668344位点变异者围孕期叶酸补充可降低其子代VSD易感性，提示遗传高风险人群更应补充叶酸以预防子代VSD的发生。[中国当代儿科杂志，2024,26 (9):899-906]