阔叶十大功劳治疗肝癌作用机制的生物信息学研究

杨霞, 杨凯平, 张学武, 林登梅, 张楠楠, 李军

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云南民族大学学报(自然科学版) ›› 2025, Vol. 34 ›› Issue (02) : 133-143.

阔叶十大功劳治疗肝癌作用机制的生物信息学研究

  • 杨霞, 杨凯平, 张学武, 林登梅, 张楠楠, 李军
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摘要

基于网络药理学和生物信息学探讨了阔叶十大功劳(Mahonia bealei (Fort.) Carr, MB)治疗肝癌的作用机制.首先,利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库获取MB的靶点,并通过基因表达综合数据库(GEO)数据库下载肝癌数据集GSE45267.使用Cytoscape软件和STRING数据库构建蛋白互作网络,并通过David数据库进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组(KEGG)富集分析.此外,运用GEPIA、THPA、UALCAN和KaplanMeier等数据库进行差异表达、蛋白分析、临床相关性和生存分析,最后通过DS BIOVIA Discovery Studio 2016 v16.1软件进行分子对接.研究筛选出8个hub基因(CCNB1、CCNB2、AURKA、CCNA2、CCNE1、CHEK1、CDK1、TOP2A),这些基因在肝癌组织中显著高表达.生存分析表明,这8个基因与总生存期和无进展生存期显著相关.分子对接结果表明,7个蛋白(CCNB1、AURKA、CCNA2、CCNE1、CHEK1、CDK1、TOP2A)可与MB的成分进行结合.综合网络药理学和生物信息学分析,发现MB通过多个成分、靶点和通路协同作用,可能对肝癌具有治疗潜力.

关键词

网络药理学 / 生物信息学 / 阔叶十大功劳 / 肝癌 / 作用机制

中图分类号

R273

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杨霞, 杨凯平, 张学武, 林登梅, 张楠楠, 李军. 阔叶十大功劳治疗肝癌作用机制的生物信息学研究. 云南民族大学学报(自然科学版). 2025, 34(02): 133-143

基金

国家自然科学基金(82060797); 贵州中医药大学大学生创新创业训练计划项目(贵中医大创合字(2022)135号)

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