目的:探讨“线上自主学习+案例库”教学模式在硕士研究生SPSS软件应用课程教学的应用效果。方法:选取皖南医学院2020、2021级125名硕士研究生(对照组)和2022级115名硕士研究生(实验组)为研究对象，对照组采用线上视频教学+SPSS软件应用(理论和实践操作),实验组在既往教学模式下，增加线上自主学习和教学案例库的学习。通过闭卷式实践考核、满意度等方式评价教学效果。结果:实验组研究生SPSS实践操作成绩[(86.77±7.02)分]高于对照组[(81.71±2.77)分](P<0.05),实验组研究生在软件操作学习效果、协助完成研究生毕业论文上满意度均高于对照组研究生(P<0.05);实验组研究生在统计学学习态度总分及情感、认知能力、兴趣维度得分上均高于对照组研究生(P<0.05)。结论:“线上自主学习+案例库”教学模式在硕士研究生SPSS软件应用课程教学中的应用能较好提高研究生实际应用能力，并解决一定的科研问题。