贝绒刺蛾Phocodermabetis线粒体全基因组测序与分析

俞旭东, 李朝品

皖南医学院学报 ›› 2024, Vol. 43 ›› Issue (01) : 90-95.

贝绒刺蛾Phocodermabetis线粒体全基因组测序与分析

  • 俞旭东, 李朝品
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摘要

目的:测定贝绒刺蛾Phocodermabetis线粒体基因组全序列,并分析其线粒体基因组碱基组成、密码子使用偏好性等特征,探讨刺蛾科在鳞翅目(Lepidoptera)中的系统发育地位。方法:利用Illumina高通量测序技术测得贝绒刺蛾完整线粒体基因组序列。通过Mitos2、Geneious v8.0.4和Phylosuite1.2.2等生物信息软件对线粒体基因组进行注释分析,并基于26种鳞翅目昆虫的13个蛋白质编码基因,使用最大似然法和贝叶斯法构建系统发育树。结果:贝绒刺蛾线粒体全基因组序列长14 919 bp(AT:80.88%),包括13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和1个AT富集区。刺蛾科线粒体基因组AT含量、AT-skew及GC-skew均表现出极高的相似性。系统发育树表明,卷夜蛾科(Tortricidae)+[透翅蛾科(Sesiidae)+木蠹蛾科(Cossidae)]+[刺蛾科(Limacodidae)+斑蛾科(Zygaenidae)]。结论:刺蛾科(Limacodidae)与斑蛾科(Zygaenidae)互为姊妹群,同属于斑蛾总科Zygaenoidea。贝绒刺蛾属于刺蛾科并与绿刺蛾属(Parasa)亲缘关系较为接近。

关键词

贝绒刺蛾 / 高通量测序 / 刺蛾科 / 线粒体基因组 / 系统发育

中图分类号

R384

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俞旭东, 李朝品. 贝绒刺蛾Phocodermabetis线粒体全基因组测序与分析. 皖南医学院学报. 2024, 43(01): 90-95

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国家级大学生创新创业训练计划项目(202110368033)

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