医工融合是新工科建设的重要发展方向，医工融合工程实践课程体系建设是实现培养高层次医工交叉型人才的重要一环。该文基于新时代卓越创新人才培养需求，研究与实践项目制为驱动的医工融合工程实践课程体系。医工融合工程实践课程体系以解决临床医学工程问题为目标、贯通式医工融合创新项目为驱动、医学工程创新思维为先导、全过程实践为主线、工程创新能力培养为核心、多元化双主体评价考核为闭环，通过医工学科交叉融合的创新实践教学模式，完成学生知识、能力、实践、创新、劳动等一体化培养，全方位提升学生的自主学习能力、实践能力、理论基础、团队协作、创新和沟通表达能力。