生物有机肥是传统有机肥与菌肥的有机结合体，功能微生物是生物有机肥的“核心”。生物有机肥主要基于将活性的功能微生物施用于土壤，旨在通过增加根际所需微生物的数量和生物活性来增加土壤肥力和促进植物生长，其施用效果受产品中有效活菌数的影响。目前，生物有机肥研制与应用研究较多，但针对功能微生物活性与生物有机肥肥效关系的相关研究相对较少。介绍生物有机肥作用机制，阐述影响生物有机肥肥效的关键因素，并对提高生物有机肥中功能微生物活性的措施进行探讨。深入了解功能微生物活性与生物有机肥肥效的关系将为生物有机肥的研究和应用提供技术支撑，进而推进我国农业绿色可持续发展。