栗瘿蜂体内一种合成生长素细菌的全基因组测序

doi:10.16605/j.cnki.1007-7847.2023.12.0225

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生命科学研究 ›› 2024, Vol. 28 ›› Issue (05) : 437-443. DOI: 10.16605/j.cnki.1007-7847.2023.12.0225

栗瘿蜂体内一种合成生长素细菌的全基因组测序

谢佳宜, 杨雪梅, 惠羽, 朱道弘, 曾杨, 杨筱慧

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摘要

致瘿昆虫体内高含量植物激素的来源尚不清楚。为探究细菌对栗瘿蜂(Drycosmusk kuriphilus)体内生长素合成的潜在影响,通过平板培养法分离出栗瘿蜂体内的两株细菌,即芽孢杆菌DK01 (Bacillus sp.)和鞘氨醇杆菌DK02 (Sphingobacterium sp.);使用第二代测序技术(Illumina Hi Seq)与第三代单分子测序技术(PacBio)测定和组装了芽孢杆菌DK01的全基因组序列,并分析了芽孢杆菌DK01的生长素合成相关基因。研究结果表明,芽孢杆菌DK01基因组的全长为4 244 232 bp, GC含量为64.53%;该基因组存在3 773个蛋白质编码区,编码了与生长素合成相关的乙醛脱氢酶、酰胺酶和腈水解酶。