探究日本落叶松种子园和人工林优树自由授粉家系苗期生长性状遗传变异规律，为优良家系造林和后期遗传改良提供参考。以沙坝国家落叶松/云杉良种基地日本落叶松初级无性系种子园25个自由授粉家系和30个人工林优树自由授粉家系为试验材料，种子园混合种子苗作为对照，田间试验采用随机完全区组试验设计，在沙坝国家落叶松云杉良种基地苗木培育圃进行苗期生长试验。数据采用SPSS 16.0进行方差分析、多重比较，并估算遗传力和遗传增益，以2年生苗地径、苗高、新梢生长量为指标，采用Brykin多性状综合评定法进行家系评价和选择。种子园、人工林优树自由授粉家系1年生苗和2年生苗生长性状（地径、苗高、2年生苗新梢生长量）具有丰富的遗传变异，生长性状间具有显著（P<0.05）或极显著（P<0.01）正相关关系，家系选择潜力大。种子园自由授粉家系2年生苗地径、苗高、新梢生长量的表型变异系数分别是27.61%、36.82%、44.28%，家系遗传力依次为0.76、0.79、0.79，人工林优树自由授粉家系地径、苗高、新梢生长量的表型变异系数分别是25.57%、32.94%、38.83%，家系遗传力依次为0.90、0.92、0.92，属较高遗传力。家系生长性状受强的遗传控制，具有一定的稳定遗传能力，家系选择的遗传增益显著。按照50%的入选率初步选择苗期表现好的优良家系，种子园有种1、种25、种8、种34、种26、种12、种16、种20、种2、种100、种7、种21、种101共13个家系入选，入选家系地径、苗高、新梢生长量的遗传增益达到1.89%、6.18%、7.65%；人工林优树自由授粉家系有优19、优8、优2、优28、优30、优3、优7、优1、优18、优6、优15、优26、优25、优24、优13共15个家系入选，入选家系的地径、苗高、新梢生长量的遗传增益分别是3.73%、9.31%、11.19%。不论种子园还是人工林优树自由授粉家系，采用Brykin综合评价法选择的优良家系恰好是将苗高最大的家系入选。因此，建议日本落叶松自由授粉家系苗期采用单一性状——苗高作为评价和选择指标，会更加直观、经济、有效。在50%的入选率下，种子园、人工林优树自由授粉家系苗期分别有13个和15个家系入选，苗期初选家系为造林试验和后期遗传改良提供参考，有效减小田间试验规模，提高选择效率。苗高作为评价和选择指标，在生产中更加直观、方便、实用。