蛇皮果（Salacca zalacca）为棕榈科蛇皮果属植物，是极具热带区域特色的果树种类，常见为雌雄异株。早期性别鉴定对合理配置蛇皮果苗木雌雄比例具有重要意义。为了获得蛇皮果早期性别鉴定的分子标记，通过收集海南省3株雌株与3株雄株蛇皮果，以叶片为材料进行转录组测序分析，筛选出19个在雌雄株间显著的差异表达基因。通过对同产地7株雌株和7株雄株蛇皮果的进一步鉴定，确定其中的Unigene0079610(GOLS1)基因能够在所检测的蛇皮果雌雄株中稳定的差异表达。由此，GOLS1基因可用作蛇皮果性别鉴定的分子标签。通过大规模转录组筛选，获得与蛇皮果性别相关的分子标签，并建立了GOLS1基因的快速检测体系。该研究结果可作为蛇皮果苗木性别鉴定的技术手段，并为其他园艺作物的性别鉴定提供了参考。