热带特色高效农业是海南省的重点主导产业。结合海南省特色种质资源和传统农业文化，打造具有海南特色和优势的特色高效农业创新模式对于发展海南省热带特色高效农业具有积极意义。本研究针对广泛分布在海南省的“木棉稻田农林复合系统”，系统总结了木棉稻田农林复合系统的传统农业文化与农耕技艺、种质资源、稻米与木棉产品品质与产量等，探讨了木棉稻田农林复合系统传统技艺的传承与利用、优质高产技术研发及其对发展当代热带特色高效农业的路径与模式，提出4个建议：（1）深入研究木棉农田生态系统资源循环过程与生态学基础；（2）充分利用传统稻种等不可替代的种质资源，打造“木棉稻米”等品牌；（3）挖掘和宣传传统农耕技艺及其科技原理，通过申报中国重要农业文化遗产等途径提高稻米和木棉花等农产品的文化与经济附加值；（4）系统打造农业、文化、生态、旅游及自然教育融合发展模式。