为了满足火龙果的产业发展需求，必须开展火龙果高产优质新品种的选育工作。收集和评价火龙果种质资源，并开展火龙果的杂交育种，是火龙果育种的主要路径。火龙果种质资源多样，遗传倍性情况不明，对种质资源的倍性进行鉴定是育种创新不可缺少的环节。本研究建立了火龙果茎尖染色体制片体系，并采用茎尖染色体制片技术以及流式细胞技术对42份火龙果种质资源进行倍性鉴定。结果表明：1）火龙果茎尖染色体制片在前低渗时间为2 h、解离时间为1.5 h、酶解时间为1 h、后低渗时间为30 min时，染色体分散程度较好，背景清晰，没有出现重叠的现象，具有完整的细胞。2）火龙果茎尖倍性稳定，是最可靠的检测材料，老熟的茎条含有大量的四倍体和八倍体细胞，不宜做倍性鉴定材料。3)42份火龙果种质资源中有二倍体材料41份，四倍体材料1份，无三倍体材料。4）以‘金都一号’为参照，进行基因组大小的预估，发现有15份火龙果种质资源的1C-value(1C)≤1.34 Gb，为极小型基因组，27份火龙果种质资源的1C值在1.35～3.34 Gb之间，为小型基因组。