为了研究稻豆轮作对土壤理化性质和微生物群落结构的影响，采用常规土壤理化分析和微生物分析方法，以在海南岛东方市实施的稻-稻-稻（RRR）连作和稻-豆-稻（RSR）轮作下的土壤为研究对象，比较了水稻连作和稻豆轮作下的土壤理化性质、碳组分和微生物群落结构的差异。结果显示，RSR处理的土壤有机质、全氮含量、有效磷、速效钾、水稻产量，均高于RRR处理，说明稻豆轮作显著提高了土壤全氮、速效钾含量并降低了pH值；土壤微生物分析结果表明，RSR处理的土壤细菌ACE、Chao1和Shannon指数值比RRR处理提高了40.2%、40.3%、5.7%；土壤微生物分析结果还表明，RSR处理的土壤真菌Shannon和Simpson指数比RRR处理提高了20.1%和16.5%。土壤微生物分析结果说明，稻豆轮作对土壤微生物群落组成产生了显著影响。土壤细菌和真菌群落组成与土壤有机质、速效钾、pH、热水可提取碳（HWEC）、微生物生物量碳（MBC）呈极显著（P<0.01）相关。本研究结果表明，稻豆轮作显著提高了土壤微生物群落结构，促进了有机质分解、提高了磷和速效钾的有效性，从而提高了作物产量。