江西省是我国首批三个“国家生态文明试验区”之一，位于中国东部亚热带常绿阔叶林腹心，横跨中国-日本森林亚区中的浙南山地亚地区和赣南-湘东丘陵亚地区，具有较高的生物多样性且拥有较多的濒危保护植物。筛选和确定江西省野生种子植物185科1 090属3 925种，并构建江西省种子植物系统发育树；同时，比较了基于物种相异性矩阵(β_sim)和系统发育相异性矩阵(pβ_sim)的种子植物和被子植物区系分区结果。结合地质历史和实地调查，认为基于种子植物pβ_sim的区系地理分区方案更合理。将江西省植物区系分为鄱阳湖区、梅岭区、龙虎山区、赣南区、赣北区和赣中区6个区；各区物种数最多的前十个科均包含菊科、蔷薇科、唇形科、豆科、莎草科、茜草科和禾本科，但物种数最多的属存在差异，特有种集中分布在赣中区。