种子活力是一个重要的小麦品质相关指标，与小麦种子发芽和穗发芽均有直接关系。为鉴定小麦种子活力相关性状的遗传位点并挖掘其相关候选基因，本研究以163份黄淮麦区小麦品种(系)构成的自然群体为材料，对其发芽率、发芽势和发芽指数3个种子活力相关性状进行调查，并结合90K SNP芯片进行全基因组关联分析。结果表明，供试小麦材料的种子发芽率、发芽势和发芽指数存在丰富的变异，变异系数范围为11.81%～25.58%。利用90K SNP芯片共鉴定到196个与3个种子活力性状相关的显著性SNPs,其中67个SNPs可以同时在3个性状中检测到；进一步通过基因表达模式和单倍型分析，推测TraesCS4B02G359600和TraesCS4A02G494700可能为调控小麦种子活力的重要候选基因。