大麦HSF基因家族成员的鉴定与表达分析

石明玉, 冯浩, 李柱刚

麦类作物学报 ›› 2025, Vol. 45 ›› Issue (07) : 922-931.

大麦HSF基因家族成员的鉴定与表达分析

  • 石明玉, 冯浩, 李柱刚
作者信息 +
History +

摘要

热激转录因子(heat shock transcription factor, HSF)家族与植物生长发育、胁迫响应密切相关。为了解大麦HSF家族成员的功能,本研究利用生物信息学方法在大麦全基因组水平进行HSF家族成员鉴定,并对其理化性质、亚细胞定位、进化关系和共线性关系及基因结构、启动子顺式作用元件、蛋白互作网络进行了分析。结果发现,在大麦中共鉴定到的29个HSF基因,HvHSF蛋白的分子量介于10.24~56.59 kDa之间,属于稳定性较差的亲水蛋白,均预测定位于细胞核。进化树将大麦HvHSF基因分为A、B、C三类;共线性分析显示,HvHSF5d和HvHSF7b为共线基因对。结构域和基因结构分析发现,亲缘关系较近的HvHSF具有相似的结构域和基因结构。启动子顺式作用元件分析发现,HvHSF启动子含有多种与生长发育以及抗逆相关的顺式作用元件。蛋白互作网络预测表明,HvHSF可能参与植物胁迫响应调节和H2O2的清除。通过大麦地下部盐、碱胁迫转录组测序结合qRT-PCR验证发现,HvHSF在盐、碱胁迫下表达存在差异。盐、碱胁迫下,HvHSF1a、HvHSF1b、HvHSF2a、HvHSF3c、HvHSF5b表达量均有所增加;HvHSF6在盐胁迫下表达量增加,碱胁迫下降低。综上,HSF家族成员可能参与大麦耐盐、碱调控。

关键词

大麦 / 热激转录因子(HSF) / 生物信息学 / 基因表达 / 系统进化发育

中图分类号

S512.3

引用本文

导出引用
石明玉, 冯浩, 李柱刚. 大麦HSF基因家族成员的鉴定与表达分析. 麦类作物学报. 2025, 45(07): 922-931

基金

北京市农业科学院科技创新能力建设专项; 国家自然科学基金青年项目

评论

Accesses

Citation

Detail

段落导航
相关文章

/